目前確定某一特定集水區和其他水源中病原體濃度最精確的方法是在一段時間內連續 對水質進行監測，同時考慮季節變化和諸如暴風雨等突發事件的影響。建議在有條件的地 區，盡可能結合正在制定的水安全計劃及目標病原體，直接檢測特定水源中的病原體和指示 性微生物，因為這樣的檢測結果可以反映微生物污染水平的最佳估計值。然而，在很多情況 下常常由于條件限制而無法實現。當缺乏病原體的檢測濃度時，一個可采用的替代辦法是 根據現有數據進行估計，如利用衛生調查結果同時結合指示生物檢測。
在社區或實施地區，當缺少水源病原體發生和分布的數據時，原水中的濃度可以從一些 觀察數據，如每克代表直接受糞便污染的糞便中或每升未處理的廢水中的病原體數量推斷 出來（表７．６）。衛生調查數據可用于評估未經處理或處理過的廢水排入原水產生的影響。 在處理過的廢水中，病原體的濃度可能減少１０～１００倍或者更多，這取決于處理工藝效率。 原水中的病原體濃度可以通過廢水中的病原體濃度及廢水在原水中的比例估計。此外，還 可以考慮在一些特定位置的原水中測定的指示性病原體的濃度，但這些濃度可能會在不同 位置變化很大。
表７．６中，可以清楚地看到糞便指示菌，如大腸桿菌在廢水中常常呈現較高濃度。每個 人都會散布大腸桿菌，但濃度變化很大。只有被感染的人散布病原體，因此，廢水中病原體 濃度變化更大。這樣的變化取決于擴散模式，也依賴于其他因素，如排放廢水的人群規模或 被其他廢水、如工業廢水稀釋的規模。傳統廢水處理在廢水被排放到地表水之前，常常降低 一到兩個數量級的微生物濃度。在其他地方，原水被直接排放，或者通過排水管溢流偶爾排 放。排放廢水被受納水體稀釋，從而減少了病原體數量，稀釋因子是因地而異。病原體失 活、死亡或進入到沉積物里也會使病原體減少。這些因子隨著表面水體和氣候的不同而變 化。這種變化說明糞便指示菌和病原體的濃度在地表水體比廢水中變化更多。
由于生存能力差別，大腸桿菌與病原體的比值在排放點和其下游是不一樣的。將大腸 桿菌數據和地表水中病原體濃度進行比較發現地表水病原體和大腸桿菌濃度總體上成正相 關，但是在大腸桿菌的任何濃度下，病原體濃度可能從低到高變化很大。甚至沒有大腸桿菌 并不保證沒有病原體或者病原體的濃度低于公共衛生要求。
表７．６中基于對實際數據的評估為確定在各種受糞便污染影響的水源中的腸道病原體濃 度提供了一個有用的參考。然而，這些數據也有很多限制性和不確定性，包括以下幾個方面：
● 盡管病原體和大腸桿菌的數據來源于世界的不同區域，但是到目前為止大多來自高 收入國家。
● 還存在對分析方法的靈敏性和穩定性的擔憂，尤其是病毒和原蟲，在檢測這些生物體 時，很大程度要通過要處理和濃縮大體積樣本加以彌補。
● 病原體計數可以使用各種方法，包括使用培養基或細胞的培養方法；基于分子的檢測 （例如聚合酶鏈式反應）和顯微鏡觀察，并對這些結果做出謹慎解釋。
● 由于缺乏病原體對人類的傳染性的知識，這樣會影響風險評估，應該得到解決。
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